Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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