Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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ITGA9Q13797 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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ITGA9Q13797 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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ITGA9Q13797 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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ITGA9Q13797 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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ITGA9Q13797 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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ITGA9Q13797 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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ITGA9Q13797 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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ITGA9Q13797 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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ITGA9Q13797 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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ITGA9Q13797 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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