Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSTA3Q13630 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSTA3Q13630 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSTA3Q13630 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSTA3Q13630 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSTA3Q13630 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSTA3Q13630 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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