Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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