Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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TRAF1Q13077 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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TRAF1Q13077 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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TRAF1Q13077 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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TRAF1Q13077 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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TRAF1Q13077 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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TRAF1Q13077 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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TRAF1Q13077 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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TRAF1Q13077 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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