Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM2Q13029 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
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