Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms