Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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