Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SREBF2Q12772 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms