Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms