Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms