Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms