Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms