Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms