Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms