Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms