Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms