Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL9Q07325 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL9Q07325 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CXCL9Q07325 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL9Q07325 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms