Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNDQ07001 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms