Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME1Q06323 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms