Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPL2Q05D32 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms