Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms