Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3AQ05086 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms