Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms