Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms