Protein–RNA interactions for Protein: Q01955

COL4A3, Collagen alpha-3(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3Q01955 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A3Q01955 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A3Q01955 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms