Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms