Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms