Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK6Q00534 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK6Q00534 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK6Q00534 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK6Q00534 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK6Q00534 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK6Q00534 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK6Q00534 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK6Q00534 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms