Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms