Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX6P78412 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms