Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HBBP68871 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HBBP68871 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms