Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms