Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO4P61968 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO4P61968 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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