Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF3P61204 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF3P61204 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF3P61204 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF3P61204 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF3P61204 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF3P61204 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF3P61204 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms