Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms