Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms