Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms