Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms