Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms