Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms