Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OXCT1P55809 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms