Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRAP54198 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRAP54198 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HIRAP54198 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIRAP54198 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIRAP54198 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIRAP54198 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms