Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A2P52657 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms