Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms