Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP2P50120 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP2P50120 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms