Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms