Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGCXP38435 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGCXP38435 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms