Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms