Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms